Pflanzen und molekularbiologische Labore
Die Unit Bioresources in Tulln bietet eine umfassende molekularbiologische, mikrobiologische und pflanzenwissenschaftliche Laborinfrastruktur. Diese ermöglicht es uns, neue Technologien und Werkzeuge zu entwickeln, die zu einer besseren Nutzung pflanzlicher und mikrobieller Ressourcen beitragen.
Molekularbiologisches Labor
Unsere molekularbiologischen Labore ermöglichen die Durchführung der wichtigsten molekularbiologischen und Protein-/Enzym-basierenden biochemischen Techniken. Wir entwickeln genetische Markersysteme unter Verwendung modernster Multi-Omik Technologien (Genomik, Transkriptomik, Phänomik) und der darauffolgenden integrativen bioinformatischen Datenanalytik. Die so entwickelten Marker werden für unterschiedlichste Genotypisierungszwecke und -fragestellungen verwendet. Dafür stützen wir uns neben den klassischen Mikrosatelliten (STRs / SSRs) auch auf Technologien wie die SNP-basierte MassARRAY® Multiplex-Genotypisierung (Agena Bioscience®) oder der Genotypisierung-durch-Sequenzierung (GBS). Gerade letztere ermöglicht uns durch die Verschneidung von Genotyp und Phänotyp mittels einer Genom-weiten Assoziationsanalyse (GWAS) die Identifizierung von Genen, welche mit bestimmten Eigenschaften (Merkmalen) einher gehen und in weiterer Folge für Zucht und Selektion zur Anwendung kommen.
Automatisierte Liquid Handling Systeme (ISO 9001: 2008) ermöglichen sichere, effiziente und präzise Hochdurchsatz-DNA-Extraktion und -Analytik. Zur Langzeit-Lagerung von biologischem Material steht unsere DNA Bank mit integriertem Datenmanagementsystem zur Verfügung (www.dnabank.at).
Pflanzenmikrobiom Labor
Pflanzen sind mit komplexen mikrobiellen Gesellschaften, sogenannten Mikrobiomen, vergesellschaftet, die eng mit ihrer Wirtspflanze interagieren. In unseren Laboren untersuchen wir diese mikrobiellen Gemeinschaften, das heißt wir führen Mikrobiom- und Metagenomanalysen inklusive bioinformatischer und statistischer Auswertung durch. Dies ermöglicht es uns, die molekularen Mechanismen der Interaktion zwischen Mikroorganismen und Pflanzen zu erforschen. Außerdem analysieren wir einzelne Genome, Transkriptome und Funktionen von individuellen Bakterien- oder Pilzstämmen und führen phylogenetische und genomische Analysen zur Stammidentifizierung durch. Zur Studie des mikrobiellen Besiedelungsverhalten von Pflanzen werden hoch-auflösende Mikroskopie-Methoden verwendet oder auch molekulare Analysen von Stamm-spezifischen Markern durchgeführt.
Um spezifische mikrobielle Anwendungen zur Verbesserung von Pflanzeneigenschaften zu entwickeln, sind ausgiebige Pflanzenversuche notwendig. Unsere Klimakammern, unser Glashaus und Drahthaus ermöglichen es, Pflanzenversuche unter (semi-)kontrollierten Bedingungen durchzuführen. Sind Feldversuche notwendig, so stehen uns über unsere Partner lokale Flächen zur Verfügung.
Bioaerosol Labor
Das Bioaerosol Labor der Bioresources Unit in Tulln ist mit einer einzigartigen Bioaerosolkammer ausgestattet, die es ermöglicht, eine kontrollierte Umgebung von luftgetragenen Mikroorganismen, in definierter Anzahl und gleichmäßiger Verteilung zu erzeugen und aufrecht zu erhalten. Auf diese Weise können wir Probenahmegeräte und -methoden reproduzierbar testen und validieren. Aufgrund der aktuellen COVID-19 Pandemie legen unsere Wissenschaftler*innen einen besonderen Schwerpunkt auf die Entwicklung und Validierung effizienter Strategien für den Nachweis von luftgetragenen Viren und die Testung von Luft- und Oberflächendesinfektion. Darüber hinaus konzentrieren sich unsere Aktivitäten im Bereich der Bioaerosolforschung auf den Nachweis biologischer Partikel aus der Luft: Pollen oder Pflanzenmaterial, Pilze, Bakterien, Sporen und Viren sowie die Entwicklung spezifischer Nachweissysteme.
